目前我国是世界上滥用抗生素最为严重的国家之一，由此造成的细菌耐药性问题尤为突出。其危害有以下四点：
一是诱发细菌耐药。原病微生物为躲避药物，在不断地变异，耐药菌株也随之产生。目前，几乎没有一种抗菌药物不存在耐药现象。
二是损害人体器官。抗菌药在杀菌的同时，也会造成人体损害，如影响肝、肾脏功能、胃肠道反应及引起再生障碍性贫血等。
三是导致二重感染。在正常情况下，人体的口腔、呼吸道、肠道都有细菌寄生，寄殖菌群在相互拮抗下维持着平衡。如果长期使用广谱抗菌药物，敏感菌会被杀灭，而不敏感菌成绩繁殖，为被抑制的细菌、真菌及外来菌也可趁虚而入，诱发又一次的感染。
四是造成社会危害。滥用抗菌药物可能引起一个地区其些细菌耐药现象的发生，对感染的治疗会变得十分困难，这样发展下去，人类将对细菌束手无策。抗生素的滥用将意味着抗生素时代的结束，如不加以遏制，在不久的将来人类将来重新回到上个世纪没有青霉素的年代。