杩戞棩锛屽寳浜灄涓氬ぇ瀛︽灄鏈ㄥ垎瀛愯偛绉嶅洟闃熻仈鍚堜腑鍥界瀛﹂櫌鍖椾含鍩哄洜缁勭爺绌舵墍锛堝浗瀹剁敓鐗╀俊鎭腑蹇冿級寮€鍙戜簡澶氬勾鐢熸湪鏈鐗╅仐浼犱俊鎭暟鎹簱PPGR (https://ngdc.cncb.ac.cn/ppgr/)锛岃鐮旂┒鎴愭灉浠モ€淧PGR: a comprehensive perennial plant genomes and regulation database鈥濅负棰樿銆婃牳閰哥爺绌躲€嬶紙Nucleic Acids Research锛�(ICR鍒嗗尯涓€鍖猴紝IF="14.9)鏀跺綍骞跺彂琛ㄣ€�
澶氬勾鐢熸湪鏈鐗╂槸閲嶈鐨勬鐗╃被缇わ紝鏄湪鏉愩€佺簿娌广€佹澗鑴傜瓑鐗规畩浠ｈ阿鐗╃殑閲嶈鏉ユ簮锛屽鏁翠釜鐢熸€佺郴缁熴€佸伐涓氬拰鍖昏嵂浜т笟鏇存湁鐫€宸ㄥぇ鐨勮础鐚€傚洜姝わ紝绮剧‘瑙ｆ瀽澶氬勾鐢熸湪鏈鐗╂湪鏉愬舰鎴愩€佹姉鎬ц皟鎺с€佷紤鐪犳満鍒躲€佹鐢熶唬璋㈣皟鎺х瓑閲嶈鐢熺墿瀛﹁繃绋嬪叧閿熀鍥狅紝寤虹珛绯荤粺鐨勯仐浼犺皟鎺х綉缁滐紝瀵逛簬闃愭槑璇ョ被缇ゆ鐗╅噸瑕佹€х姸鐢熺墿瀛﹀熀纭€銆佸垎瀛愯偛绉嶅拰绉嶈川鍒涙柊鍏锋湁閲嶈鐨勬剰涔夈€�
杩戝勾鏉ワ紝闅忕潃澶氬勾鐢熸湪鏈鐗╃殑鍩哄洜缁勫拰鍔熻兘鐮旂┒鐨勬繁鍏ワ紝澶ч噺鐨勬暟鎹笉鏂骇鐢熴€傜劧鑰岋紝杩欎簺鏁版嵁鐨勬敹闆嗐€佸瓨鍌ㄧ鐞嗐€佸姛鑳芥寲鎺樺拰寮€鍙戝埄鐢ㄤ竴鐩存槸璇ラ鍩熷彂灞曠殑鏍稿績闂銆備负浜嗚В鍐宠繖浜涢棶棰橈紝PPGR鍦ㄥ骞寸敓鏈ㄦ湰妞嶇墿鏁版嵁鏍囧噯鍖栫殑鍩虹涓婏紝鎻愪緵浜嗗缁勫澶ф暟鎹瓨鍌ㄣ€佸垎鏋愩€佸叡浜拰鍙鍖栨湇鍔°€侾PGR鐨勫紑鍙戝疄鐜颁簡澶氬勾鐢熸湪鏈鐗╃粍瀛﹁祫婧愮殑绯荤粺绠＄悊鍜岄珮鏁堝埄鐢紝涓哄骞寸敓鏈ㄦ湰妞嶇墿閬椾紶鏀硅壇銆佸姛鑳藉熀鍥犵粍瀛︾爺绌躲€佸垎瀛愯偛绉嶆彁渚涗簡鏂扮殑閲嶈閬椾紶璧勬簮鍜屾湁鍔涘伐鍏枫€�
PPGR鏁村悎浜嗘瘺鏋滄潹銆佹补鏉俱€佸ぇ妗夈€侀摱鏉忕瓑60绉嶆湪鏈鐗╃殑鍩哄洜缁勬暟鎹紝搴旂敤鏍囧噯鍖栨祦绋嬪垎鏋愪簡9,016涓浆褰曠粍鏁版嵁闆嗭紝PPGR璁＄畻浜�107,344涓浆褰曞洜瀛愩€�10,263涓姉鐥� (NLR) 鍩哄洜銆佷互鍙�53,829涓按骞宠浆绉诲熀鍥犮€�8.47浜挎潯鍩哄洜浜掍綔瀵圭敤鏉ユ瀯寤哄缁村熀鍥犺皟鎺х綉缁滐紝閲嶇粯浜嗗鏉℃湪鏈鐗╅噸瑕佷唬璋㈤€氳矾锛堟湪鏉愬舰鎴愩€佸鑺傛€т紤鐪犮€佽悳鐑敓鐗╁悎鎴愬拰鍙剁墖琛拌€侊級锛屽叾涓寘娑典簡87,372涓€氳矾鍊欓€夊熀鍥犮€傚彟澶朠PGR杩樻彁渚涗簡鐩稿簲妯″潡渚涚敤鎴锋祻瑙堝垎鏋愬缁勫鏁版嵁锛屽叿澶囪緝寮虹殑瀹炵敤鎬у拰浜や簰鎬э紝骞朵笖鎻愪緵浜嗏€滀竴绔欏紡鈥濆垎鏋愮粨鏋滅殑鍦ㄧ嚎闆嗘垚宸ュ叿浠ユ柟渚跨敤鎴峰鍩哄洜闆嗗悎杩涜鍔熻兘瀵岄泦鍒嗘瀽 (GO銆並EGG)銆佽皟鎺х綉缁滄绱€€佸簭鍒楀垎鏋�(鍚姩瀛愬簭鍒梞otif 棰勬祴涓庡瘜闆�) 鍜孊LAST銆�
PPGR: 澶氬勾鐢熸湪鏈鐗╅仐浼犱俊鎭暟鎹簱
PPGR鏄竴涓叏闈㈢殑澶氬勾鐢熸湪鏈鐗╄祫婧愬簱锛岀敤鎴峰彲浠ラ€氳繃鍩哄洜鍚嶇О鎴栧熀鍥犵储寮曞揩閫熻幏鍙栨劅鍏磋叮鍩哄洜鐨勪綅缃€佺粨鏋勩€佸姛鑳藉煙銆佷唬璋㈤€氳矾銆佸悓婧愬熀鍥犮€佷簰浣滃熀鍥犮€佽皟鎺ч€氳矾銆佽〃杈炬ā寮忕瓑鐩稿叧澶氱粍瀛︿俊鎭€傚湪澶氱淮鍩哄洜璋冩帶缃戠粶鏋勫缓杩囩▼涓紝PPGR閲囩敤浜嗘枃鏈櫤鑳芥寲鎺樸€佹枃鐚暟鎹汉宸ュ缂栥€佷簰浣滈娴嬬畻娉曠瓑澶氱鏂瑰紡瀵硅泲鐧�-铔嬬櫧銆佽浆褰曞洜瀛�-闈舵爣銆佸叡琛ㄨ揪缃戠粶鍦ㄥ唴鐨勫绉嶄俊鎭繘琛岄珮鏁堟暣鍚堝苟棰勬祴銆傞櫎姝や箣澶栵紝鍩轰簬閬椾紶璋冩帶缃戠粶鐨勫垎瀛愯偛绉嶆ā鍧楁鍦ㄥ紑鍙戯紝杩戞湡灏嗗簲鐢ㄤ簬璇ユ暟鎹簱銆�
鎴2024骞�3鏈堬紝PPGR宸叉垚鍔熸敹褰曚簡浼楀涓庡骞寸敓妞嶇墿鍩哄洜缁勫拰璋冩帶鐩稿叧鐨勬暟鎹紝杩欎竴瀹濊吹鐨勮祫婧愭棤鐤戝皢鍔犻€熷骞寸敓妞嶇墿鍩哄洜缁勫拰璋冩帶鐮旂┒棰嗗煙鐨勫彂灞曘€傞殢鐫€PPGR鏁版嵁搴撶殑鎺ㄥ嚭锛岄璁″皢涓烘灄鏈ㄥ熀鍥犵粍瀛﹀拰鍩哄洜璋冩帶鐮旂┒棰嗗煙甯︽潵鏇村鐨勭鐮旂獊鐮村拰鍙戠幇銆�
鍖椾含鏋椾笟澶у鐢熺墿瀛﹂櫌纭曞＋鐮旂┒鐢熸潹妫紝涓浗绉戝闄㈠熀鍥犵粍鐮旂┒鎵€鍗氬＋鐮旂┒鐢熷畻鏂囧┓涓鸿鏂囩涓€浣滆€咃紱鍖椾含鏋椾笟澶у鐢熺墿瀛﹂櫌璋㈠墤娉㈡暀鎺堬紝涓浗绉戝闄㈠寳浜熀鍥犵粍鐮旂┒鎵€鏉庤尮濮ｇ爺绌跺憳锛屼腑鍥界瀛﹂櫌鍖椾含鍩哄洜缁勭爺绌舵墍椴嶄竴鏄庣爺绌跺憳涓洪€氳浣滆€呫€傜爺绌跺伐浣滃緱鍒板浗瀹堕噸鐐圭爺鍙戣鍒掋€佸浗瀹惰嚜鐒剁瀛﹀熀閲戜紭绉€闈掑勾鍩洪噾銆佸浗瀹舵灄鑽夊眬闈掑勾鎷斿皷浜烘墠绛夐」鐩殑鑱斿悎璧勫姪銆�
璁烘枃閾炬帴锛�https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkad963/7337612?searchresult="1
